山西省中医药研究院成立于1957年，原名山西省中医研究所、山西省中医研究所附属医院；1963年接收山西省西医离职学习中医研究班；1994年更名为山西省中医药研究院；1995年接收山西省创伤骨科研究所及其医院筹备处；2005年增挂山西省中医院院牌；2006年接收山西中医杂志社；2007年7月增挂北京中医药大学附属山西省中医院院牌。近两年相继接收太原市类风湿病医院、山西稷山骨髓炎医院、孝义市中医院等为山西省中医药研究院非直属附属医院。